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瓊脂糖核酸電泳,選擇紫外還是藍(lán)光?

 更新時(shí)間:2023-10-16 點(diǎn)擊量:950

DNA分子是一種自身不會(huì)發(fā)出熒光的大分子,需要相應(yīng)的核酸分子染料結(jié)合到DNA分子的大溝處,通過激發(fā)光激發(fā)DNA –核酸染料復(fù)合物,復(fù)合物會(huì)發(fā)出一束強(qiáng)熒光,通過相應(yīng)的濾光片過濾得到單波長(zhǎng)的發(fā)射光,通過照相機(jī)或者肉眼捕獲就能夠檢測(cè)到相應(yīng)的DNA分子。那么瓊脂糖核酸電泳要選擇紫外還是藍(lán)光呢?讓我們一起來(lái)看看吧!

從核酸電泳發(fā)展至今,絕大多數(shù)的分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室選擇溴化乙錠(EtBr,也簡(jiǎn)稱EB)作為核酸分子染料,由于EB的光譜特性,又不得不選擇紫外光作為激發(fā)光。EB分子因其分子量較小,容易透過細(xì)胞膜,因此是一種致癌性ji強(qiáng)的有機(jī)小分子。而紫外光(UV)照射也會(huì)誘發(fā)基因突變,不僅會(huì)引發(fā)實(shí)驗(yàn)樣品的基因突變,也會(huì)對(duì)實(shí)驗(yàn)人員造成一定的傷害。

為了解決EB分子的致癌問題,科研工作者通過有機(jī)合成技術(shù)將兩個(gè)EB分子通過有機(jī)分子鏈連在了一起,解決了EB分子因分子量比較小容易通過細(xì)胞膜的問題,連在一起的分子被稱為GelRed。這雖然解決了染料相對(duì)安全的問題,可激發(fā)光依然是UV,不能夠從本質(zhì)上解決對(duì)實(shí)驗(yàn)樣品和實(shí)驗(yàn)操作者自身的安全問題。

事實(shí)上,除了EB和GelRed這兩種以UV為激發(fā)光的核酸分子染料,還存在另一類核酸分子染料,如:GelGreen、SYBR Green、SYBR Gold、LED Green、SYBR Safe、GoldView等以480nm藍(lán)光為激發(fā)光的核酸染料,這類染料分子量相對(duì)較大,細(xì)胞膜通透性較差,因此對(duì)實(shí)驗(yàn)人員帶來(lái)的危害較小,相對(duì)EB分子是一種較安全的核酸分子染料。

由于波長(zhǎng)470nm藍(lán)光屬于可見光,不會(huì)對(duì)實(shí)驗(yàn)樣品造成破壞,也不會(huì)對(duì)實(shí)驗(yàn)人員造成危害,因此470nm的藍(lán)光搭配安全核酸分子染料能夠zui大程度降低核酸瓊脂糖凝膠電泳帶來(lái)的潛在危險(xiǎn)。

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